|
|
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite; Embrapa Suínos e Aves. |
Data corrente: |
19/12/2011 |
Data da última atualização: |
05/02/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
NASCIMENTO, C. S.; MACHADO, M. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; MARTINS, M. F.; PEIXOTO, J. de O.; FURLONG, J.; PRATA, M. C. de A.; VERNEQUE, R. da S.; TEODORO, R. L.; LOPES, P. S. |
Afiliação: |
C. S. NASCIMENTO, UFV; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; S. E. F. GUIMARÃES, UFV; MARTA FONSECA MARTINS, CNPGL; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; JOHN FURLONG, CNPGL; MARCIA CRISTINA DE AZEVEDO PRATA, CNPGL; RUI DA SILVA VERNEQUE, CNPGL; ROBERTO LUIZ TEODORO, Pesquisador aposentado do CNPGL; P. S. LOPES, UFV. |
Título: |
Expressed sequenced tags profiling of resistant and susceptible Gyr x Holstein cattle infested with the tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus. |
Ano de publicação: |
2011 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 10, n. 4, 2011. |
Páginas: |
14 p. |
DOI: |
https://doi.org/10.4238/2011.november.8.3 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Tick resistance in cattle is mainly found in zebu (Bos indicus) animals, although it is also present in some taurine (B. taurus) breeds. In order to characterize functional genes involved in tick resistance/susceptibility in cattle, two cDNA libraries were generated using skin tissues of selected Holstein x Gyr animals. A total of 2700 high-quality reads from both resistant and susceptible cDNA were assembled into 458 sequences (contigs) and 834 singletons, with a mean size of 447.7 nucleotides. Assignment of homologous proteins by BLASTX revealed 790 (61.1%) and 300 (23.2%) hits in resistant and susceptible cDNA, respectively; 121 of these hits matched bovine proteins. A total of 502 (38.9%) unique sequences were found to have no significant homology with known sequences and were classified as novel sequences. In general, the most abundant sequences consisted of those coding for hypothetical proteins whose function had not yet been determined, in addition to ribosomal proteins, binding proteins and structural proteins, such as keratin and collagen. The most abundant protein found was collagen type III alpha, although ribosomal proteins accounted for half of the 40 most frequent hits. In addition, five matches within the top 40 best hits corresponded to immune response proteins. These sequences could be used for future studies on functional genomics of cattle tick resistance as well as for genomic sequencing projects. |
Palavras-Chave: |
Bovine; CDNA library; Crossbreeds; Skin. |
Thesagro: |
Bovino; Genética. |
Thesaurus Nal: |
expressed sequence tags. |
Categoria do assunto: |
-- L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/50834/1/Artigo-meta-2011-gmr1506-Marco-Antonio.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/56217/1/EXPRESSED-SEQUENCED.pdf
|
Marc: |
LEADER 02454naa a2200337 a 4500 001 1910262 005 2024-02-05 008 2011 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.4238/2011.november.8.3$2DOI 100 1 $aNASCIMENTO, C. S. 245 $aExpressed sequenced tags profiling of resistant and susceptible Gyr x Holstein cattle infested with the tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus.$h[electronic resource] 260 $c2011 300 $a14 p. 520 $aTick resistance in cattle is mainly found in zebu (Bos indicus) animals, although it is also present in some taurine (B. taurus) breeds. In order to characterize functional genes involved in tick resistance/susceptibility in cattle, two cDNA libraries were generated using skin tissues of selected Holstein x Gyr animals. A total of 2700 high-quality reads from both resistant and susceptible cDNA were assembled into 458 sequences (contigs) and 834 singletons, with a mean size of 447.7 nucleotides. Assignment of homologous proteins by BLASTX revealed 790 (61.1%) and 300 (23.2%) hits in resistant and susceptible cDNA, respectively; 121 of these hits matched bovine proteins. A total of 502 (38.9%) unique sequences were found to have no significant homology with known sequences and were classified as novel sequences. In general, the most abundant sequences consisted of those coding for hypothetical proteins whose function had not yet been determined, in addition to ribosomal proteins, binding proteins and structural proteins, such as keratin and collagen. The most abundant protein found was collagen type III alpha, although ribosomal proteins accounted for half of the 40 most frequent hits. In addition, five matches within the top 40 best hits corresponded to immune response proteins. These sequences could be used for future studies on functional genomics of cattle tick resistance as well as for genomic sequencing projects. 650 $aexpressed sequence tags 650 $aBovino 650 $aGenética 653 $aBovine 653 $aCDNA library 653 $aCrossbreeds 653 $aSkin 700 1 $aMACHADO, M. A. 700 1 $aGUIMARÃES, S. E. F. 700 1 $aMARTINS, M. F. 700 1 $aPEIXOTO, J. de O. 700 1 $aFURLONG, J. 700 1 $aPRATA, M. C. de A. 700 1 $aVERNEQUE, R. da S. 700 1 $aTEODORO, R. L. 700 1 $aLOPES, P. S. 773 $tGenetics and Molecular Research$gv. 10, n. 4, 2011.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registros recuperados : 18 | |
2. | | NASCIMENTO, C. S.; TERRA, V. S. S.; MADOLOZ, L.; REISSER JUNIOR, C.; PEREIRA, J. F. M. Influência da cobertura plástica na produção de frutos de pessegueiro, cultivares maciel e eldorado. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTIFICA, 18.; ENCONTRO DE PÓS GRADUAÇÃO, 11., E MOSTRA CIENTIFICA, 1., 2009, Pelotas. Anais... Pelotas: UFPel, 2009. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
| |
3. | | NASCIMENTO, C. S.; TERRA, V. S. S.; MADOLOZ, L.; REISSER JUNIOR, C.; PEREIRA, J. F. M. Influência da cobertura plástica na produção de frutos de pessegueiro, cultivares Maciel e Eldorado. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 18.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 11.; MOSTRA CIENTÍFICA, 1., 2009, Pelotas. Anais... Pelotas : Univesidade Federal de Pelotas, 2009. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
| |
4. | | PEREIRA, A. V.; MACHADO, M. A.; AZEVEDO, A. L. S.; NASCIMENTO, C. S.; CAMPOS, A. L.; LÉDO, F. J. S. Diversidade genética entre acessos de capim-elefante obtida com marcadores moleculares. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, MG, v. 37, n. 7, p. 1216-1221, 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
5. | | SILVA, P. V.; MIRANDA, C. L.; FONSECA, I.; GUIMARÃES, M. F. M.; GUIMARÃES, S. E. F.; NASCIMENTO, C. S.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, J. D. Avaliação de dois métodos para extração de RNA total de células da granulosa de fêmeas suínas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2007. p. 118.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
6. | | NASCIMENTO, C. S. DO; WELLER, M. M. DEL C. A.; LIMA FILHO, L.; DOMINGUES, R.; GUIMARAES, S. E. F.; MACHADO, M. A. Construção e caracterização de bibliotecas de cDNA de pele de bovinos F2 (Holandês X Gir) infestados com carrapato Riphicephalus (Boophilus) microplus. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Anais... Maringá: SBZ, 2009.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
7. | | NASCIMENTO, C. S.; MACHADO, M. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; GUIMARÃES, M. F. M.; CAMPOS, A. L.; VERNEQUE, R. da S.; LOPES, P. S. Expressão aumentada do gene S100A7 em bovinos F2 desafiados com o parasita Boophilus microplus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2007. p. 241.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
8. | | MIRANDA, C. L.; FONSECA, I.; SILVA, P. V.; NASCIMENTO, C. S.; GUIMARÃES, S. E. F.; GUIMARÃES, M. F. M.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, J. D. Expressão diferencial do gene p4r (receptor de progesterona) em células da granulosa de suínos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2007. p. 74.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
9. | | NASCIMENTO, C. S. do; MACHADO, M. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; GUIMARAES, M. F. M.; PEIXOTO, J. O.; FURLONG, J.; PRATA, M. C. de A.; VERNEQUE, R. da S.; TEODORO, R. L.; LOPES, P. S. Differential expression of genes in resistant versus susceptible Gyr x Holstein cattle challenged with the tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Genetics and Molecular Research, v. 9, n. 4, p. 1974-1979, 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
10. | | NASCIMENTO, C. S.; MACHADO, M. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; MARTINS, M. F.; PEIXOTO, J. de O.; FURLONG, J.; PRATA, M. C. de A.; VERNEQUE, R. da S.; TEODORO, R. L.; LOPES, P. S. Expressed sequenced tags profiling of resistant and susceptible Gyr x Holstein cattle infested with the tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Genetics and Molecular Research, v. 10, n. 4, 2011. 14 p.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Suínos e Aves. |
| |
11. | | AZEVEDO, A. L. S.; NASCIMENTO, C. S.; STEINBERG, R. S.; CARVALHO, M. R. S.; PEIXOTO, M. G. C. D.; TEODORO, R. L.; VERNEQUE, R. S.; GUIMARÃES, S. E. F.; MACHADO, M. A. Genetic polymorphism of the kappa-casein gene in Brazilian cattle. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 7, n. 3, p. 623-630, 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
12. | | SILVA, M. V. G. B.; MARTINEZ, M. L.; MACHADO, M. A.; NASCIMENTO, C. S. do; CAMPOS, A. L.; GUIMARÃES, M. F. M.; AZEVEDO, A. L. S.; MOITA, A. K. F.; LUI, J. F. Genes do eixo somatotrófico e características de crescimento numa população F2 de bovinos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 41, n. 6, p. 981-986, jun. 2006 Título em inglês: Somatotrophic axis genes on growth traits in a bovine F2 population.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
| |
13. | | VERARDO, L. L.; NASCIMENTO, C. S.; SILVA, F. F.; GASPARINO, E.; MARTINS, M. F.; TORIYAMA, E.; FARIA, V. R.; BOTELHO, M. E.; COSTA, K. A.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Identification and validation of differentially expressed genes from pig skeletal muscle. Journal of Animal Breeding and Genetics, v. 130, n. 5, p. 372-381, 2012.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
14. | | NASCIMENTO, C. S.; PEIXOTO, J. de O.; VERARDO, L. L.; CAMPOS, C. F.; WELLER, M. M. C.; FARIA, V. R.; BOTELHO, M. E.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; SILVA, F. F.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Transcript profiling of expressed sequence tag from semimembranosus muscle of commercial and naturalized pig breeds. Genetics and Molecular Research, v. 11, n. 3, p. 3315-3328. 2012.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
15. | | SOUSA, B. M. de L.; RIZATO, C. A.; FAGUNDES, J. L.; FONTES, P. T. N.; BACKES, A. A.; OLIVEIRA JÚNIOR, L. F. G. de; CRUZ, N. T.; NASCIMENTO, C. S. do. Tillering dynamics of digit grass subjected to different defoliation frequencies. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 54, e00668, 2019. Título em português: Dinâmica do perfilhamento do capim faixa-branca submetido a diferentes frequências de desfolhação.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
| |
16. | | PAIXÃO, D. M.; CARNEIRO, P. L. S.; PAIVA, S. R.; SOUSA, K. R. S.; VERARDO, L. L.; BRACCINI NETO, J.; PINTO, A. P. G.; HIDALGO, A. M.; NASCIMENTO, C. S. do; PÉRISSÉ, I. V.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Mapeamento de QTL nos cromossomos 1, 2, 3, 12, 14, 15 e X em suínos: características de carcaça e qualidade de carne. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, v. 64, n. 4, p. 974-982, 2012.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
17. | | ROTTA, P. P.; VALADARES FILHO, S. C.; GIONBELLI, T. R. S.; COSTA E SILVA, L. F.; ENGLE, T. E.; MARCONDES, M. I.; GUIMARÃES, S. E. F.; NASCIMENTO, C. S.; CARVALHO, B. C. de; SILVA, F. A. S.; OLIVEIRA, J. R. S. Effects of day of gestation and feeding regimen in Holstein × Gyr cows: III. Placental adaptations and placentome gene expression. Journal of Dairy Science, v. 98, p. 3224-3235, 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
18. | | NASCIMENTO, C. S.; PEIXOTO, J. de O.; VERARDO, L. L.; CAMPOS, C. F.; WELLER, M. M. DEL C. A.; FARIA, V. R.; BOTELHO, M. E.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; SILVA, F. F.; LOPES, S. E. F.; GUIMARÂES. S. E. F. Transcript profiling of expressed sequence tags from semimembranosus muscle of commercial and naturalized pig breeds. Genetics and molecular research, n. 11 (AOP), 2012. Projeto: 02.10.06.003Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
Registros recuperados : 18 | |
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|